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Webinar «Oportunidades presentes y futuras de la metagenómica»

By | Sobre Microomics

¿Te interesa la metagenómica? Entonces, presta atención.

 

Ayer publicábamos la noticia del acuerdo de colaboración entre la empresa Condalab y Microomics para aumentar la visibilidad de nuestros servicios a nivel nacional. En ella mencionábamos la realización de un webinar promocionado por Condalab y en el que Pedro González, CEO y Co-fundador de Microomics Systems participará como ponente.

La charla comenzará con una breve introducción a la metagenómica y, más en detalle, a la metagenómica bacteriana y luego se analizarán las oportunidades de su aplicación en estudios clínicos y preclínicos. La sesión finalizará tratando las perspectivas de futuro de esta tecnología para el análisis del microbioma y una ronda de preguntas final.

La sesión será el próximo 29 de septiembre a las 10h.

Para inscribirte solo tienes que hacer click aquí o en el botón «Inscríbete al Webinar» y rellenar el formulario de inscripción. ¡Te animamos a apuntarte y conocernos!

 

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Acuerdo comercial entre Microomics y la empresa Condalab

By | Sobre Microomics

Microomics aumenta la visibilidad de sus servicios a nivel nacional

 

En septiembre Microomics Systems S.L. alcanza un nuevo hito, ya que nuestros servicios de Metagenómica formarán parte del catálogo ofertado por la empresa Condalab. Este acuerdo ofrecerá a los clientes de Condalab nuestra experiencia en investigación y en el análisis de comunidades microbianas (microbiomas).

 

Condalab nació en 1960 como el primer fabricante español de medios de cultivo deshidratados para microbiología y biología molecular, siendo reconocida, a nivel internacional por fabricar componentes clave como agar, peptona o agarosa, entre otros. Además, son distribuidores exclusivos en España de compañías en el área de la biología molecular y celular de prestigio internacional.

Logo Condalab

Con esta colaboración, Microomics espera poder llegar a más empresas y grupos de investigación que estén interesados en estudiar el microbioma. Con nuestro servicio integral 360º asesoramos a las personas interesadas en todas las etapas de un proyecto, desde evaluar que herramienta metagenómica es la más adecuada para su tipo de muestra, pasando por las etapas de biología molecular (extracción de ácidos nucleicos y preparación de librerías) y análisis bioinformáticos y estadísticos.

 

La misión conjunta de contribuir al conocimiento y progreso en el campo de las ciencias de la vida son puntos clave en la filosofía de ambas partes, hecho que ha motivado esta colaboración.

 

Como fruto de este acuerdo, Pedro González, CEO de Microomics, participará en el webinar del próximo 29 de septiembre, a las 10h, promocionado por Condalab, donde hablará sobre metagenómica, su aplicación en estudios clínicos y preclínicos y la perspectiva de futuro de esta tecnología para el análisis del microbioma. Para inscribirte solo tienes que hacer click aquí o en el botón y rellenar el formulario de inscripción. ¡Te animamos a apuntarte y conocernos!

¿Qué es el microbioma?

By | Divulgación

El microbioma: la comunidad de microorganismos que viaja siempre contigo

 

El microbioma  humano es el conjunto de microorganismos,  que conviven en el cuerpo humano. Formado por eucariotas, arqueas, bacterias y virus acumula una cantidad de 100 billones de microorganismos que representan alrededor del 2 al 3% del peso total del cuerpo humano. También ha sido llamado «el órgano perdido» y «el genoma extendido»1 ya que cumple funciones vitales como ser la  regulación de la expresión de genes,  la prevención de enfermedades, la absorción de ciertos nutrientes no sintetizables por el cuerpo humano  y  la regulación del sistema inmune.

La coevolución con el microbioma ha desarrollado complejos ecosistemas adaptados para regular implacablemente la fisiología del cuerpo humano2.

 

Muchos son los estudios que investigan el impacto del microbioma en la salud y que han demostrado que la disbiosis, cambios en el equilibrio del microbioma, está fuertemente asociada a numerosas enfermedades, incluyendo enfermedad inflamatoria intestinal, esclerosis múltiple, diabetes (tipos 1 y 2), alergias, asma, autismo y cáncer, entre otras. El estudio de microbiomas de poblaciones sanas, es un primer paso esencial para identificar y corregir configuraciones microbianas implicadas en  enfermedades2. Esto permite establecer niveles de referencia para el estudio del efecto y monitorización de intervenciones y tratamientos.

El microbioma humano es el conjunto de microorganismos que conviven en el cuerpo humano.

Imagen: Ilustración del microbioma humano.

Se denomina metagenoma al conjunto de genomas presentes en un microbioma, y la metagenómica es la disciplina que lo estudia. Se basa  en secuenciar el ADN microbiano que hay en una muestra, sin necesidad de aislar y cultivar cada una de las especies que la componen, para determinar la biodiversidad existente en la comunidad microbiana presente en dicha muestra y las interacciones entre los diferentes organismos que la componen. Para ello, se puede o bien secuenciar el genoma completo de forma conjunta o secuenciar de forma más dirigida, por ejemplo al gen de bacterias 16S.

 

El principal gran avance que ha permitido la metagenómica es explorar el microbioma sin depender del cultivo de sus microorganismos, por lo tanto accediendo a la diversidad microbiana no cultivable, que hasta el momento no habían podido ser analizadas. Por esta razón, ahora se pueden saber sus características, funciones y relaciones con otros seres vivos3. Durante la última década se ha producido un boom en el uso de la metagenómica, demostrando que existe una compleja  variabilidad y diversidad entre microbiomas de individuos sanos. El estudio de esta diversidad se remonta, al menos, a los años 1960, continuando a través del Proyecto de Microbioma Humano y más allá, desde el uso del cultivo clásico a las actuales tecnologías de secuenciación masiva que permiten la exploración directa mediante el análisis del DNA.

En la actualidad se está produciendo una revolución en nuestra comprensión del microbioma. Hace una década, se sabía muy poco del inventario de microorganismos que habitan diferentes partes del cuerpo humano, cómo se ensamblan en comunidades de diversos niveles de complejidad, y cómo se relacionan con microbiomas en otras especies.

 

El Proyecto Microbioma Humano (PMH) constituye el mayor hito en la historia del estudio del microbioma. Surgió como una iniciativa del Instituto Nacional de Salud (NIH), Estados Unidos, con el objetivo de la identificación y caracterización de los microorganismos que se encuentran asociados a humanos, tanto en la salud como en la enfermedad. El fin último de éste era probar cómo los cambios en el microbioma humano están asociados con la salud o enfermedad humana4. Este proyecto estableció las pautas básicas de análisis a la hora de abordar el análisis del microbioma humano.

La caracterización de los diversos ambientes microbianos ha permitido establecer un catálogo de especies biomarcadoras vinculados a características de cada individuo. De este modo es posible identificar características que distingan ampliamente los microbiomas saludables de los no saludables, contribuyendo el diagnóstico de enfermedades relacionadas con este y podría potencialmente proporcionar nuevos medios para prevenir la aparición de enfermedades o mejorar el pronóstico. Durante el PMH se analizaron un total de 4.788 muestras procedentes de 242 donantes asintomáticos, y los investigadores pudieron concluir que hay una independencia microbiana entre las diferentes partes del cuerpo humano, pero que, a su vez, existen comunidades conservadas y especificas del hospedador.

Microbioma humano y subtipos según la zona corporal. Morgan et al. 2013 (doi-10.1016j.tig_.2012.09.005).

Cabe mencionar que no solo los seres humanos coexisten con su microbioma sino que también lo hacen los animales y las plantas. También los suelos, los océanos e incluso los edificios tienen un microbioma asociado. En este sentido el estudio de las comunidades  microbianas del suelo, especialmente de aquellas que interactúan con las plantas, nos puede acercar a mejoras agronómicas en nuestros campos en condiciones de interacción con los factores ambientales5.

Las preguntas que nos formulamos alrededor del impacto del microbioma tanto en salud humana como en aspectos agroalimentarios y ecológicos se pueden responder gracias al uso actual de metagenómica y bioinformática. La era de las tecnologías -ómicas nos permitirá romper muchas barreras de desconocimiento hasta el momento.

 

 

 

  1. Coronel, Roberto I. Ramírez García / José Manuel Segovia. «El microbioma humano – Revista ¿Cómo ves? – Dirección General de Divulgación de la Ciencia de la UNAM». www.comoves.unam.mx.

 

  1. Lloyd-Price J, Abu-Ali G, Huttenhower C. The healthy human microbiome. Genome Med. 2016 Apr 27;8(1):51. doi: 10.1186/s13073-016-0307-y. PMID: 27122046; PMCID: PMC4848870.

 

  1. Davenport ER, Sanders JG, Song SJ, Amato KR, Clark AG, Knight R. The human microbiome in evolution. BMC Biol. 2017 Dec 27;15(1):127. doi: 10.1186/s12915-017-0454-7. PMID: 29282061; PMCID: PMC5744394.

 

  1. Data Analysis and Coordination Center (DACC) for the Human Microbiome Project (HMP). hmpdacc.org/hmp

 

  1. ERICE, P. BONINI, V. CIRINO, G. COLLA Y M. RUZZI. Influencia del microbioma del suelo en el rendimiento del cultivo de pimiento. Phytoma. 2019 May