Metagenómica Shotgun

Secuencia el DNA total de una comunidad microbiana compuesta por bacterias, hongos, virus o una combinación de ellos. El servicio incluye secuenciación Illumina Hiseq 2500 125×2 paired end, ensamblaje y anotación funcional. Adicionalmente puede incluir análisis metagenómicos comparativos como la identificación de ortólogos, mapeo genómico o reclutamiento, afiliación taxonómica y contextualización filogenética, abundancia relativa de grupos filogenéticos mayoritarios o estudio de genes con interés funcional especial o potencial (patogenicidad, resistencia, virulencia, biorremediación e identificación de genes de plásmidos).

DIRIGIDO A

Agricultura y ganadería

Efecto funcional de pre y probióticos en animales.

Desarrollo de fertilizantes de nueva generación.

Caracterización funcional de la fertilidad del suelo.

Detección de potenciales patógenos activos en diversos cultivos vegetales.

Salud: Clínicas, hospitales y farma

Monitorización y control de salas blancas.

Monitorización funcional de dietas.

Caracterización de resistomas.

Industria de bienes de consumo

Monitorización de la actividad funcional bacteriana en productos biofermentados.

Detección de biomarcadores y funciones enzimáticas.

Control de calidad y actividad funcional en aguas.

Detección de cepas de interés.

Centros de investigación

Estudios funcionales de enfermedades humanas: Obesidad, diabetes, Crhon, celiaquía entre otras.

Perfiles de actividad funcionales en estudios ambientales: océanos, suelos, aguas continentales.

Ensayos funcionales con pre y probióticos.

COMPROMETIDOS CONTIGO

Asesoramiento durante el diseño experimental

Calidad q30 garantizada para el 70% de tus secuencias

Anotación e interpretación functional con diversos softwares y pipelines dedicados

Informe detallado personalizado y rápida entrega de resultados (10 semanas)

Consulta de Servicio Metagenómica Shotgun

Para que podamos aportarte más información y una oferta personalizada, explícanos qué servicio te interesa y el número aproximado de muestras a analizar.


     

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